Hujan deras yang mengguyur bumi MBS akhirnya membawa hasil juga, MBS Putra akhirnya kebanjiran. Walaupun air hanya menggenangi Asrama Amien Rais saja... namun juga memberikan dampak yang cukup besar bagi santri MBS. Selain aktivitas santri yang terganggu dengan adanya banjir, sampah yang hanyut terbawa banjir juga mengotori seluruh area pondok.

MBS Putra dilanda banjir 2 kali dalam satu minggu ini. Banjir pertama terjadi pada saat ABAS 7 berlangsung. Hujan deras yang mengguyur MBS Putra pada 20 Desember 2015 dari setelah dhuhur hingga mendekati waktu maghrib ini, mampu membuat MBS Putra banjir....

Dan banjir kedua terjadi ketika dimana santri MBS Putra kembali dari tempat berlangsungnya ABAS 7 pada tanggal 23 Desember 2015. Beberapa santri sudah membersihkan asramanya ketika sampai di pondok di pagi hari. Namun Allah berkehendak lain. Ketika santri beristirahat di siang hari, Hujan turun dengan lebatnya. Dan MBS Putrapun dilanda banjir untuk kedua kalinya.